MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 1107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	530341461
2	NC_022051	CAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341461
3	NC_022051	CTACTT	2	12	672	683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530341461
4	NC_022051	TAT	2	6	684	689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341461
5	NC_022051	TGA	3	9	756	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341462
6	NC_022051	AT	3	6	796	801	50 %	50 %	0 %	0 %	530341462
7	NC_022051	ATCA	2	8	823	830	50 %	25 %	0 %	25 %	530341462
8	NC_022051	CAAGA	2	10	897	906	60 %	0 %	20 %	20 %	530341462
9	NC_022051	T	7	7	949	955	0 %	100 %	0 %	0 %	530341462
10	NC_022051	CTG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341462
11	NC_022051	TCC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341462
12	NC_022051	TAG	2	6	996	1001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341462
13	NC_022051	ACC	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341462
14	NC_022051	AAT	2	6	1096	1101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341462
15	NC_022051	ATT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341463
16	NC_022051	CAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341463
17	NC_022051	CAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341463
18	NC_022051	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341463
19	NC_022051	CAG	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341463
20	NC_022051	TAC	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341463
21	NC_022051	A	6	6	1309	1314	100 %	0 %	0 %	0 %	530341463
22	NC_022051	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
23	NC_022051	AAT	2	6	1396	1401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341463
24	NC_022051	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
25	NC_022051	CTG	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341463
26	NC_022051	ATA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341463
27	NC_022051	AAG	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
28	NC_022051	TTA	2	6	2408	2413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341464
29	NC_022051	A	7	7	2453	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
30	NC_022051	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	530341464
31	NC_022051	TGAT	2	8	2690	2697	25 %	50 %	25 %	0 %	530341464
32	NC_022051	AT	3	6	2729	2734	50 %	50 %	0 %	0 %	530341464
33	NC_022051	A	6	6	2743	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
34	NC_022051	T	7	7	2830	2836	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
35	NC_022051	TGC	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341464
36	NC_022051	TGC	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341464
37	NC_022051	GCA	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341464
38	NC_022051	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341464
39	NC_022051	GAAA	2	8	3076	3083	75 %	0 %	25 %	0 %	530341464
40	NC_022051	CTA	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
41	NC_022051	CTA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
42	NC_022051	A	6	6	3340	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
43	NC_022051	GTTT	2	8	3365	3372	0 %	75 %	25 %	0 %	530341464
44	NC_022051	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
45	NC_022051	ATT	2	6	3490	3495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341464
46	NC_022051	T	6	6	3494	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
47	NC_022051	AGA	2	6	3523	3528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
48	NC_022051	AATA	2	8	3547	3554	75 %	25 %	0 %	0 %	530341464
49	NC_022051	AAT	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341464
50	NC_022051	ATC	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
51	NC_022051	ATT	2	6	3852	3857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341465
52	NC_022051	AG	3	6	3884	3889	50 %	0 %	50 %	0 %	530341465
53	NC_022051	ATT	2	6	4020	4025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341465
54	NC_022051	AAAG	2	8	4161	4168	75 %	0 %	25 %	0 %	530341465
55	NC_022051	GCC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530341465
56	NC_022051	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341465
57	NC_022051	AT	3	6	4273	4278	50 %	50 %	0 %	0 %	530341465
58	NC_022051	TTTCT	2	10	4315	4324	0 %	80 %	0 %	20 %	530341465
59	NC_022051	AATA	2	8	4334	4341	75 %	25 %	0 %	0 %	530341465
60	NC_022051	TG	3	6	4377	4382	0 %	50 %	50 %	0 %	530341465
61	NC_022051	AGT	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341465
62	NC_022051	ATG	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341465
63	NC_022051	GTGA	2	8	4619	4626	25 %	25 %	50 %	0 %	530341466
64	NC_022051	A	8	8	4639	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
65	NC_022051	CAAA	2	8	4675	4682	75 %	0 %	0 %	25 %	530341466
66	NC_022051	A	6	6	4701	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
67	NC_022051	CAA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341466
68	NC_022051	CATG	2	8	4763	4770	25 %	25 %	25 %	25 %	530341466
69	NC_022051	CAA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341466
70	NC_022051	TTA	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341466
71	NC_022051	GA	3	6	5040	5045	50 %	0 %	50 %	0 %	530341466
72	NC_022051	ATA	2	6	5071	5076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341466
73	NC_022051	A	6	6	5111	5116	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
74	NC_022051	GTTT	2	8	5125	5132	0 %	75 %	25 %	0 %	530341467
75	NC_022051	A	8	8	5133	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
76	NC_022051	TAAA	2	8	5143	5150	75 %	25 %	0 %	0 %	530341467
77	NC_022051	GAT	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
78	NC_022051	TAG	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
79	NC_022051	ATC	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341467
80	NC_022051	TACTT	2	10	5249	5258	20 %	60 %	0 %	20 %	530341467
81	NC_022051	AT	3	6	5276	5281	50 %	50 %	0 %	0 %	530341467
82	NC_022051	TCC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341467
83	NC_022051	AT	3	6	5297	5302	50 %	50 %	0 %	0 %	530341467
84	NC_022051	CCA	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341467
85	NC_022051	GCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341467
86	NC_022051	TGA	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
87	NC_022051	CTT	2	6	5398	5403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341467
88	NC_022051	TTG	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341467
89	NC_022051	GTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
90	NC_022051	TGG	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341467
91	NC_022051	CT	3	6	5464	5469	0 %	50 %	0 %	50 %	530341467
92	NC_022051	ATA	2	6	5483	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341467
93	NC_022051	TCA	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
94	NC_022051	TAG	3	9	5821	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341468
95	NC_022051	AATG	2	8	5905	5912	50 %	25 %	25 %	0 %	530341468
96	NC_022051	TCG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341468
97	NC_022051	CAG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341468
98	NC_022051	CAT	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
99	NC_022051	CCA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341468
100	NC_022051	TAT	2	6	6057	6062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
101	NC_022051	TAT	2	6	6168	6173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
102	NC_022051	ATA	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
103	NC_022051	GT	3	6	6191	6196	0 %	50 %	50 %	0 %	530341468
104	NC_022051	GCA	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341468
105	NC_022051	TTC	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
106	NC_022051	GATA	2	8	6560	6567	50 %	25 %	25 %	0 %	530341468
107	NC_022051	TTC	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
108	NC_022051	T	6	6	6710	6715	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
109	NC_022051	CAC	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341468
110	NC_022051	GGA	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341468
111	NC_022051	ATA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
112	NC_022051	CTT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
113	NC_022051	T	7	7	6991	6997	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
114	NC_022051	CTT	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
115	NC_022051	TCA	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
116	NC_022051	TGC	2	6	7093	7098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341468
117	NC_022051	GAA	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341468
118	NC_022051	CCAT	2	8	7133	7140	25 %	25 %	0 %	50 %	530341468
119	NC_022051	T	6	6	7146	7151	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
120	NC_022051	ATA	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
121	NC_022051	TCG	2	6	7175	7180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341468
122	NC_022051	CTT	2	6	7236	7241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
123	NC_022051	TAC	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
124	NC_022051	AAT	2	6	7375	7380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
125	NC_022051	CTT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
126	NC_022051	TAAA	2	8	7443	7450	75 %	25 %	0 %	0 %	530341468
127	NC_022051	CCA	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341468
128	NC_022051	ATT	3	9	7463	7471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
129	NC_022051	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	530341468
130	NC_022051	TAA	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
131	NC_022051	CAA	2	6	7536	7541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341468
132	NC_022051	AG	3	6	7553	7558	50 %	0 %	50 %	0 %	530341468
133	NC_022051	TAA	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
134	NC_022051	TCA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
135	NC_022051	ATC	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
136	NC_022051	CTT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
137	NC_022051	TTC	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
138	NC_022051	TTG	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341468
139	NC_022051	T	7	7	7757	7763	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
140	NC_022051	T	6	6	7812	7817	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
141	NC_022051	CTT	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341469
142	NC_022051	TAA	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341469
143	NC_022051	TAG	2	6	7906	7911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341469
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146	NC_022051	GTT	2	6	7978	7983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341469
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150	NC_022051	CT	3	6	8564	8569	0 %	50 %	0 %	50 %	530341470
151	NC_022051	GATA	2	8	8570	8577	50 %	25 %	25 %	0 %	530341470
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153	NC_022051	CT	3	6	8683	8688	0 %	50 %	0 %	50 %	530341470
154	NC_022051	TAA	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341470
155	NC_022051	AAT	2	6	8752	8757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341470
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157	NC_022051	TAA	2	6	8795	8800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341470
158	NC_022051	GAT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341470
159	NC_022051	TCA	2	6	8848	8853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341470
160	NC_022051	CAC	2	6	8897	8902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341470
161	NC_022051	CTT	2	6	8921	8926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341470
162	NC_022051	T	6	6	8978	8983	0 %	100 %	0 %	0 %	530341470
163	NC_022051	ATTTTC	2	12	9058	9069	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	530341470
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165	NC_022051	A	7	7	9233	9239	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
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167	NC_022051	A	7	7	9310	9316	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
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170	NC_022051	TGG	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341471
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178	NC_022051	AAT	3	9	9781	9789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
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257	NC_022051	AGT	2	6	13822	13827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341474
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263	NC_022051	TA	3	6	14271	14276	50 %	50 %	0 %	0 %	530341474
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267	NC_022051	GTT	2	6	14372	14377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341474
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396	NC_022051	CTT	2	6	20306	20311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341479
397	NC_022051	CAT	2	6	20348	20353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341479
398	NC_022051	TCA	2	6	20395	20400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341479
399	NC_022051	T	6	6	20412	20417	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
400	NC_022051	AAT	2	6	20436	20441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341479
401	NC_022051	GTG	2	6	20452	20457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341479
402	NC_022051	TAA	3	9	20495	20503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341479
403	NC_022051	T	6	6	20538	20543	0 %	100 %	0 %	0 %	530341479
404	NC_022051	TTC	2	6	20547	20552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341479
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410	NC_022051	A	6	6	20997	21002	100 %	0 %	0 %	0 %	530341480
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414	NC_022051	AG	3	6	21297	21302	50 %	0 %	50 %	0 %	530341481
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478	NC_022051	T	6	6	24940	24945	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
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482	NC_022051	CAT	2	6	25099	25104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341484
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491	NC_022051	TGT	2	6	25489	25494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341485
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493	NC_022051	TTTG	2	8	25632	25639	0 %	75 %	25 %	0 %	530341485
494	NC_022051	GAC	2	6	25651	25656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341485
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496	NC_022051	TAC	2	6	25735	25740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341485
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499	NC_022051	T	6	6	26075	26080	0 %	100 %	0 %	0 %	530341485
500	NC_022051	AAT	2	6	26135	26140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341485

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